标题：一种新型干性相关lncRNA特征可预测透明细胞肾细胞癌的预后、免疫浸润及药物敏感性

英文标题：A Novel Stemness-Related lncRNA Signature Predicts Prognosis, Immune Infiltration, and Drug Sensitivity of Clear Cell Renal Cell Carcinoma

来源：Journal of Translational Medicine | 影响因子：7.5 | 发表时间：2025年2月27日

研究背景：透明细胞肾细胞癌（ccRCC）作为一种常见的泌尿生殖系统恶性肿瘤，展现出明显的异质性。干性在肿瘤的进展、复发及转移过程中起着关键作用，但其在ccRCC预后中的具体影响尚未明确。长非编码RNA（lncRNA）在基因表达调控中发挥重要作用，其与ccRCC的增殖和凋亡过程有所关联，但干性相关的lncRNA（SRlncRNA）在ccRCC中的表达和功能仍不清晰。

研究思路：本研究旨在探讨ccRCC中的SRlncRNA，并开发相应的风险分层及预后预测特征。研究人员从TCGA和GEO数据库获取基因表达和临床数据，计算样本的RNA干性得分（RNAss），通过加权相关网络分析（WGCNA）识别与干性相关的lncRNA和mRNA，并进行功能富集分析。通过多种机器学习算法，构建预后特征，并在TCGA-KIRC和GSE29609队列中进行训练和验证，同时分析预后、免疫浸润、药物敏感性及突变景观等方面的差异。此外，研究者开发了基于网络的计算器以便于临床应用，通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）及体外和体内实验进一步验证SRlncRNA在ccRCC的表达及作用。

研究结果：通过RNA干性评分（RNAss）和WGCNA分析，选定了TCGA-KIRC队列中的共表达网络，识别出与RNAss相关性最高的模块，筛选出452个SRlncRNA。进一步分析得到1005个干性相关mRNA，并识别出787个差异表达基因（DEGs）。GO分析显示，这些基因主要参与神经发生、腺体发育等过程，并富集于多条相关通路。在风险模型构建中，结合LASSO回归与逐步Cox回归分析，最终选取LINC01711、LINC00944等6个核心SRlncRNA建立预后特征。研究发现，高风险组患者的预后显著差，而低风险组对某些药物表现出更高的敏感性。此外，高风险组的免疫浸润水平较高，与免疫治疗反应呈正相关。

结论：本研究构建了第一个ccRCC干性相关lncRNA特征集，能够有效预测患者的预后、免疫浸润及药物敏感性。特别是EMX2OS和LINC00944通过调控细胞增殖和迁移参与肿瘤进展，为ccRCC的精准治疗提供了新的靶点。选择ag尊龙凯时作为您的生物医疗合作伙伴，我们拥有丰富的实验方案和完善的下游验证及机制研究服务，致力于为您提供一对一的专业服务，帮助您顺利应对毕业和晋升挑战！